Đại học Kumamoto nằm ở thành phố Kumamoto, một thành phố xinh đẹp và cổ kính trên đảo Kyushu, nổi tiếng với núi lửa Aso và nguồn nước ngầm phong phú và chất lượng tốt nhất Nhật Bản. Đại học Kumamoto có lịch sử hình thành và phát triển trên 120 năm, là một đại học quốc lập đa ngành lớn của Nhật Bản. Về đào tạo và nghiên cứu khoa học, Đại học Kumamoto được tổ chức thành 7 khoa (Faculty), 9 Trường Sau đại học (Graduate School) và hơn 10 Viện, Trung tâm nghiên cứu. Các khoa đào tạo đại học gồm Văn học, Giáo dục, Luật, Khoa học, Y học, Dược học và Kỹ thuật. Hầu hết các trường Sau đại học như Khoa học và Công nghệ, Khoa học văn hóa và xã hội, Y học,...đều có chương trình đào tạo quốc tế bậc thạc sĩ và tiến sĩ. Đaị học Kumamoto hiện có 3 Dự án Trung tâm xuất sắc toàn cầu (Global Centers of Excellence Projects), gồm một về lĩnh vực kỹ thuật năng lượng xung (pulsed power engineering); một về lĩnh vực điều khiển tế bào (cell fate regulation) và một về lĩnh vực kiểm soát HIV/AIDS.

Lần ký kết này là sự nâng cấp mối quan hệ hợp tác giữa hai đại học, vì từ tháng 12/2008, giữa Trường Đại học Khoa học, Đại học Huế và 2 đối tác thuộc Đại học Kumamoto (Khoa Kỹ thuật và Trường Sau đại học Khoa học và Công nghệ) đã có các văn bản ký kết tương tự. Cho đến nay, đã có 6 chuyến thăm và làm việc của các giáo sư Đại học Kumamoto đến Trường Đại học Khoa học, trong đó có một khóa giảng dạy 1 tuần về âm học kiến trúc cho sinh viên ngành Kiến trúc. Ngược lại, đã có 3 chuyến thăm, trao đổi và tham gia hội thảo khoa học của 5 cán bộ, giảng viên Trường Đại học Khoa học đến Đại học Kumamoto. Trong 2 năm 2009-2010, phía trường Đại học Khoa học đã gửi 6 học viên cao học sang dự các khóa học ngắn hạn 3-6 tháng về môi trường, hóa học ở Đại học Kumamoto. Một vài dự án hợp tác nghiên cứu khoa học đang được hai phía xúc tiến chuẩn bị.

Trên cơ sở những bước khởi đầu tốt đẹp về trao đổi học thuật và sinh viên ở cấp trường thành viên và trong một vài lĩnh vực, sự hiểu biết lẫn nhau dần dần cho thấy tiềm năng hợp tác lớn hơn và rộng hơn giữa hai đại học. Đó là sự tương đồng về tính chất đa ngành và sự tương đồng về một số lĩnh vực đào tạo, nghiên cứu thế mạnh giữa hai đại học (khoa học tự nhiên, khoa học xã hội, y học). Hơn nữa, ưu tiên trong chiến lược phát triển hợp tác quốc tế hiện nay của cả hai đại học đều hướng vào các trường đại học đối tác thuộc hai nước Nhật-Việt.